ビルド環境と実行速度の関係? 回避方法募集中

話は続いているのですが、一緒にすると訳がわからなくなるので分けてます。
それで、他の派生版での速度はどうなのかと調べてみた結果が以下です。

バージョン 時間(秒)
for WindowsMobile5(配布版) 4.8
for HTC Universal 4.7
Custom 4.7

ファイル表示関連は全く触っていなかったのに、何ゆえ1秒近く差があるんでしょうか。多少なりとも弄っているなら自分のせいですが、全く触れていないのにこの差は納得がいきません。納得が行かないので、試しにWindowsMobile5を自前でビルドしたバージョンで計測してみました。

バージョン 時間(秒)
for WindowsMobile5(自前ビルド) 5.7

ありゃ? 何故か配布版と速度が違います。
SDKをWM5に揃えて確かめてみても同じ傾向なので、恐らくビルド環境の差*1だと思いますが、これだけ差が付くとなると馬鹿に出来ません。同じ割合で速度アップが出来るなら、高速化した新バージョンではWindowsフォルダの表示が2.7秒で終わる計算です。
さすがにビルド環境を切り替えるわけにはいきませんが、それ以外の方法でこの速度差を回避する方法があれば教えていただけると嬉しいです。とはいっても、目に見える部分での最適化設定は一応全部速度寄りに振ってあるはずなんですけどね。

*1:かわ。氏は推定eMbedded Visual Tools、私はVisual Studio 2005